Termometr zaokienny należy wyrzucić do odpowiedniego pojemnika w zależności od jego typu: rtęciowy do odpadów medycznych, a elektroniczny do PSZOK-u lub do pojemnika na elektrośmieci.
Termometry rtęciowe zawierają metal, który jest szkodliwy dla środowiska i zdrowia, dlatego powinny być odpowiednio segregowane i trafiać do specjalnych pojemników na odpady medyczne, często dostępnych w aptekach. Termometry elektroniczne, z drugiej strony, zawierają różne elementy elektroniczne, które również wymagają specjalnego przetwarzania. Punkty Selektywnej Zbiórki Odpadów Komunalnych (PSZOK) oraz specjalne pojemniki na elektrośmieci są przeznaczone do bezpiecznego gromadzenia i późniejszego przetwarzania tego typu odpadów. Wyrzucanie takich odpadów w niewłaściwym miejscu może prowadzić do zanieczyszczenia środowiska i utrudniać proces recyklingu.